地面水常常受到土壤、工业污水废水、生活污水及各种杂质的污染，促使细菌滋生，有时每毫升水中细菌数可达几万乃至几十万个在有的水域里，大肠杆菌甚至达数万个以上。虽然在水处理的过程中，经过混凝、沉淀(或澄清)、过滤等的净化过程，粘附在悬浮物上的大部分细菌、大肠肝菌、病原菌和其他一些微生物也一同被除去。但是，并不彻底，还存在一定量的对人体有害的微生物。
       为了防止疾病的传播，还必须进行水的灭菌、消毒工作。为此在混凝澄清过滤之后还需进行消毒。在工业冷却水处理中，为了防止循环水不产生生物粘泥，因此，对于作为循环水系统补充水的过滤水，亦需要进行消毒杀菌处